Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms