Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COMMD3Q9UBI1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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