Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RNF7Q9UBF6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RNF7Q9UBF6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RNF7Q9UBF6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF7Q9UBF6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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