Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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