Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms