Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSD3Q9NYI0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms