Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms