Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDAP2Q9NXN4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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