Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNAJC28Q9NX36 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms