Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX14

NDUFB11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB11Q9NX14 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFB11Q9NX14 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms