Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL11Q9NVR0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms