Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms