Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms