Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LIN28AQ9H9Z2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms