Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC134Q9H6E4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC134Q9H6E4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms