Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSD3Q9BZ95 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms