Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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