Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MESP1Q9BRJ9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms