Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPPED1Q9BRF8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms