Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMSS1Q9BQ75 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms