Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms