Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms