Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms