Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms