Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHDQ96IW2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms