Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMA16Q96EY4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMA16Q96EY4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms