Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM12Q96EX1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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