Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTHRC1Q96CG8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms