Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL3LQ92901 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms