Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSRNP3Q8WYN3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms