Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APH1BQ8WW43 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms