Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTF18Q8WVB6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTF18Q8WVB6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms