Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTLL11Q8NHH1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL11Q8NHH1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms