Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST4Q8NFU0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms