Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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CNNM3Q8NE01 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNNM3Q8NE01 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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CNNM3Q8NE01 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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CNNM3Q8NE01 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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CNNM3Q8NE01 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNNM3Q8NE01 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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