Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8N402 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8N402 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8N402 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8N402 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms