Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPAP2Q8IXW5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms