Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIX1LQ8IVB5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIX1LQ8IVB5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms