Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP54Q7Z3B4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms