Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAF7Q6Q0C0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms