Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LETMD1Q6P1Q0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms