Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms