Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SAMD5Q5TGI4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms