Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms