Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms