Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYTL3Q4VX76 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms