Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00303Q3SY05 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms