Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM16Q2WEN9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms