Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms