Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B3Q16720 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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